珍稀特有魚類保護是生態(tài)保護工作的重要組成部分。近些年來，昭通市強化日常監(jiān)管，開展科研監(jiān)測、魚類增殖放流、棲息地修復，推進保護區(qū)建設，制定三個技術規(guī)程，全力做好赤水河云南段珍稀特有魚類保護工作。

長江上游珍稀特有魚類國家級自然保護區(qū)云南段分赤水河河源段和金沙江水富段兩個區(qū)域，保護區(qū)河流流經(jīng)鎮(zhèn)雄、威信、水富3個縣（市），流域面積1983平方公里。赤水河云南段是長江上游重要的魚類棲息地，也是長江上游珍稀特有魚類國家級自然保護區(qū)云南段的主體，分布有魚類59種，分屬5目12科，占赤水河全境魚類種類總數(shù)的50.9%。以定居性的冷水性激流底棲魚類為主，其中昭通特有魚類17種。

為讓魚類有個良好的生存環(huán)境，近兩年來，在市委、市政府的堅強領導下，昭通各級各部門和長江上游珍稀特有魚類國家級自然保護區(qū)云南管護局（以下簡稱“珍稀魚類管護局”）主動扛起赤水河流域保護源頭責任，重點從五個方面全力做好赤水河云南段珍稀特有魚類保護工作。一是強化日常監(jiān)管，配合做好禁捕工作。根據(jù)河道分布情況把保護區(qū)河道劃分為18個巡護區(qū)域，聘請20名巡護員開展日常巡護工作，對魚類產(chǎn)卵場、索餌場、越冬場、洄游通道等生態(tài)環(huán)境敏感性和村莊、交通要道等重點河段、重要區(qū)域進行重點監(jiān)管。二是加強科普宣傳教育，推進社區(qū)共建共管。先后印制5萬余份宣傳折頁、宣傳冊、宣傳帽，在多個小學開展“小手拉大手，爭做護魚人”“依法保護赤水河，獻禮建黨100周年”等宣傳活動，制作了30余幅墻體標語、建立了50余座界碑。三是做好科研監(jiān)測，開展魚類棲息地修復。珍稀魚類管護局在保護區(qū)重點河段進行魚類、水生植物、浮游植物、浮游動物、底棲生物和棲息地生境調(diào)查；對魚洞、簸笠兩個小水電站拆除地段進行棲息地修復。四是開展魚類增殖放流，修復水域生態(tài)。利用生態(tài)監(jiān)測數(shù)據(jù)研判魚類種群結(jié)構(gòu)情況，科學開展增殖放流。2020年籌集資金42萬元，增殖放流昆明裂腹魚7.8萬尾、金沙鱸鯉3500尾、云南光唇3.8萬尾；今年籌集資金232萬元，增殖放流胭脂魚8.5萬尾、巖原鯉16萬尾、長江鱘3000尾、中華倒刺鲃11萬尾、昆明裂腹魚5萬尾、金沙鱸鯉2500尾、云南光唇3.5萬尾。五是推進保護區(qū)項目實施，不斷提高保護成效。加強生態(tài)補償項目實施，持續(xù)開展工程施工專項監(jiān)管、水環(huán)境生態(tài)監(jiān)測、漁業(yè)資源調(diào)查等工作。珍稀魚類管護局完成總體規(guī)劃編制和保護區(qū)勘界工作并上報了有關成果。

為使赤水河云南段珍稀特有魚類保護工作進一步科學化、規(guī)范化、標準化，昭通市市場監(jiān)督管理局、珍稀魚類管護局聯(lián)合西南大學擬定了《長江上游珍稀特有魚類國家級自然保護區(qū)云南段水域魚類增殖放流技術規(guī)程》《長江上游珍稀特有魚類國家級自然保護區(qū)云南段巡護技術規(guī)程》《長江上游珍稀特有魚類國家級自然保護區(qū)云南段生物多樣性監(jiān)測技術規(guī)程》，于10月8日起正式實施。增殖放流技術規(guī)程規(guī)定了保護區(qū)魚類增殖放流的基本程序，實施主體為珍稀魚類管護局，其他任何單位、法人及個人在保護區(qū)水域放流須征得有關部門同意。物種選擇以保護區(qū)內(nèi)的土著魚類作為放流對象，禁止向天然水域放流雜交種、轉(zhuǎn)基因種、外來物種及其他種質(zhì)不純的物種，物種必須由省級以上漁業(yè)行政主管部門批準或認可的原、良種場站提供，苗種應當是本地種的原種或者子一代，對增殖放流的物種應進行技術鑒定與檢驗檢疫。巡護技術規(guī)程規(guī)定了保護區(qū)巡護的原則、巡護程序、安全要求、巡護成果等技術要求，適用于本保護區(qū)的巡護工作。巡護內(nèi)容包括日常巡護、稽查巡護、監(jiān)測巡護，并對巡護方式、巡護時段、巡護頻次分別作了規(guī)定。生物多樣性監(jiān)測技術規(guī)程對監(jiān)測準備、監(jiān)測斷面或樣點設置、魚類早期資源調(diào)查，魚類物種多樣性調(diào)查、聲吶水聲學調(diào)查、環(huán)境DNA監(jiān)測等方面的監(jiān)測方法作了詳細規(guī)定，并規(guī)定了監(jiān)測指標、監(jiān)測時間和頻次、斷面設置、質(zhì)量控制和安全管理、監(jiān)測報告編制等方面的內(nèi)容。