參軍后，蔡有根立即投入戰(zhàn)斗。他隨軍四處征戰(zhàn)，還參加了淮海戰(zhàn)役。他說，淮海戰(zhàn)役上國民黨軍隊有80萬，解放軍僅有60萬。但在黨的領導與人民群眾的支持之下，戰(zhàn)役最終以解放軍的全面勝利告終。

1949年5月，在河北麻城百萬大軍過長江中，蔡有根因表現(xiàn)英勇榮獲甲等功。過江后，他所在部隊在廣西欽州與國民黨白崇禧兵團作戰(zhàn)。當部隊在欽州宿營時，聽到中華人民共和國成立的消息，戰(zhàn)士們激動萬分，互相擁抱，慶賀新中國的成立。

后來，部隊又繼續(xù)南下，從廣西百色進入貴州盤縣，經(jīng)云南富源，輾轉至陸良召夸，與國民黨殘部展開激烈交戰(zhàn)，1950年2月，蔡有根隨部隊進入昆明，獲得了十四軍頒授的特等功臣榮譽稱號。

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到云南后，蔡有根先在騰沖保衛(wèi)邊疆，鞏固國防，1956年調往陸良，兩年后又到西盟邊防八團任通訊連副連長，隨后分別在昆明與墨江工作多年。1969年6月，蔡有根轉業(yè)至陸良，先后擔任陸良大修廠副廠長、陸良農機化學校書記等職，為建設祖國邊疆做出了貢獻。